Помимо классической модели, Patek Philippe выпускает различные версии Nautilus. Среди них — часы с усложнениями, такими как хронограф или турбийон. Женские модели отличаются меньшим размером и изысканными деталями. Некоторые версии имеют бриллиантовые или золотые элементы. Каждая коллекция сохраняет дух оригинала, но предлагает новые решения.